IMIS - Innovation en imagerie pour la santé

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Laboratory

Icube (IMIS)

Site internet

Nom de l’équipe

IMIS - Innovation en imagerie pour la santé

Contact

Veronika Vallion

Business Developer (Chimie - Ecotechnologies - Technologies Medicales )

(+ 33) 610070019

Thématiques de recherche

•   Neuro-crypto : étude anatomo-fonctionnelle du cerveau par l’imagerie
•   Métabolomiquemédicale
•   Innovation en imagerie pour la santé

Expertises

•   Physique, physiologie, Neuroscience
•   Analyse des profils métaboliques par RMN HRMAS (high resolutionmagic angle spectroscopy)
•   IRM 3D (anatomique, fonctionnelle) Homme et petit animal
•   méthodes d’analyses statistiques multi-variées (PCA, PLS)
•   tomographieoptique 3D
•   Traitement images médicales

Applications

•   Etudedes pathologies qui s'accompagnent d'une réorganisation de la connectivité cérébrale: pathologies neuro-développementales (autismes, schizophrénies) mais aussi dans les pathologies neuro-dégénératives
•   recherche de biomarqueurs diagnostiques, pronostiques ou thérapeutiques de maladies neurologiques (maladie à corps de Lewy et la Maladie d’Alzheimer)ou psychiatriques présentant des anomalies cryptiques
•   développementcérébral et néonatal
•   Identification d’empreintes métaboliques comme biomarqueurs pronostiques et théranostiques en oncologie ou de suivi après transplantation

Equipements spécifiques

•   Spectroscopie RMN Haute résolution (HR-MAS),seul spectromètre actuellement implanté en site clinique en France
•   IRM corps entier 3T
•   IRM petit animal 7T

Publications

Blanc F. et al.,Right Anterior Insula: Core Region of Hallucinations in Cognitive Neurodegenerative Diseases, PLoS ONE 2014 <http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25479196>

Benahmed M et al., The metabolomics by NMR HRMAS in the assessment of the quality of the graft after in situ cold preservation in non-heart-beating pig model of lung transplantation, Magnetic Resonance in MedicineAnnée?

Dietemann,S et al., FDG-PET findings of the brain in sudden blindness caused by bilateral central retinal artery occlusion revealing giant cell arteritis, ClinNucl Med. 2015.<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25275418>

Ernst A et al., Functional cerebral changes in multiple sclerosis patients during an autobiographical memory test, Memory 2014<http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25244436>

Plateformes

In vivo imaging platform

Langue Indéfini

Description

Morphological NMR imaging (MRI) in humans at 3T Functional MRI (fMRI) in humans at 3T Small animal morphological MRI at 7T Small animal functional MRI at 7T Robotized Transcranial magnetic stimulation (rTMS)

Descriptif des prestations

3D imaging of the human brain with a millimeter resolution
Determination of the brain areas activated by a specific task
Determination of the brain structures involved in all brain functions, including cognitive functions
Description of the neural circuits involved in a brain function
Resting-state functional connectivity
Visualization of brain structures of small animal with a resolution of 100 microns

Moyens et équipements

MR System- dedicated exclusively to clinical studies, research and development:

Siemens Verio 3T MR scanner equipped with Tim (Total imaging matrix) technology.
MR-compatible patient monitoring system (EEG, pulse, respiration, ...).
MR-compatible audio/visual stimulation devices for fMRI.
MR-compatible EEG.

Small Animal Imaging Systems - dedicated to research and development:

Bruker 7.0 T small bore (30-cm) MR animal system.
Gas anesthesia system, heating and monitoring system (EEG, pulse, respiration, ...)
Transitory animal facility

Site internet de la plateforme

http://http://icube-imis.unistra.fr

Domaines d’applications

Imagerie

Microscopie

MediPy

Langue Indéfini

Description

MediPy est une plateforme logicielle de visualisation et de traitement d'images médicales. Elle est destinée à la fois aux cliniciens et aux chercheurs en étant à la fois facile d'utilisation et ouverte à l'extension de ses fonctionnalités.

Descriptif des prestations

Les cliniciens pourront bénéficier des tâches pré-programmées (par exemple la segmentation, le recalage ou la détection de lésions) et la possibilité de définir de nouvelles tâches, leur permettant d'adapter le logiciel à leurs besoins propres. De nombreux formats de fichiers peuvent être lus (DICOM, NIfTI, Analyze, …), et la récupération de données depuis un PACS est également possible.

Les chercheurs pourront rapidement développer de nouveaux outils en se basant sur des interfaces soit en Python pour une forte productivité, soit en C++ pour de hautes performances. Des ponts permettent un échange facile des données entre les deux langages. Des adaptateurs sont de plus prévus pour l'utilisation de bibliothèques tierces, au niveau traitement (par exemple SPM ou ITK) ou au niveau visualisation (par exemple VTK).

Moyens et équipements

MediPy est un logiciel libre (sous licence CeCILL-B) et multi-plateformes (Linux et Windows, avec une version Mac OS en cours de développement). Le code source du logiciel est disponible sur Google Code, un site intranet est également disponible.

Domaines d’applications

SANTE - SCIENCES DE LA VIE

Neurologie - Psychiatrie

Cancérologie

Neurosciences

Dispositifs médicaux

Imagerie

Modèles animaux

RMN - Spectroscopie